MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 108585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019738	CTG	2	6	217740	217745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308556
3002	NC_019738	AC	3	6	217884	217889	50 %	0 %	0 %	50 %	428308556
3003	NC_019738	CAA	2	6	217949	217954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308556
3004	NC_019738	TTGA	2	8	218031	218038	25 %	50 %	25 %	0 %	428308556
3005	NC_019738	TG	3	6	218097	218102	0 %	50 %	50 %	0 %	428308556
3006	NC_019738	CGC	2	6	218220	218225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308556
3007	NC_019738	GACT	2	8	218437	218444	25 %	25 %	25 %	25 %	428308557
3008	NC_019738	TCAC	2	8	218515	218522	25 %	25 %	0 %	50 %	428308557
3009	NC_019738	TC	3	6	218523	218528	0 %	50 %	0 %	50 %	428308557
3010	NC_019738	A	6	6	218602	218607	100 %	0 %	0 %	0 %	428308557
3011	NC_019738	TGAA	2	8	218617	218624	50 %	25 %	25 %	0 %	428308557
3012	NC_019738	TGAG	2	8	218641	218648	25 %	25 %	50 %	0 %	428308557
3013	NC_019738	CAGCAC	2	12	218732	218743	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428308557
3014	NC_019738	GGC	2	6	218818	218823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308557
3015	NC_019738	CAAT	2	8	218872	218879	50 %	25 %	0 %	25 %	428308557
3016	NC_019738	GCT	2	6	218918	218923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308557
3017	NC_019738	GTA	2	6	218963	218968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308557
3018	NC_019738	GCG	2	6	219151	219156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308557
3019	NC_019738	CAAA	2	8	219158	219165	75 %	0 %	0 %	25 %	428308557
3020	NC_019738	CAA	2	6	219180	219185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308557
3021	NC_019738	TCA	2	6	219353	219358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308557
3022	NC_019738	CCA	2	6	219387	219392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308557
3023	NC_019738	TAA	2	6	219420	219425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308557
3024	NC_019738	G	6	6	219441	219446	0 %	0 %	100 %	0 %	428308557
3025	NC_019738	TAAA	2	8	219561	219568	75 %	25 %	0 %	0 %	428308557
3026	NC_019738	TAA	2	6	219621	219626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308557
3027	NC_019738	CGG	2	6	219862	219867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308558
3028	NC_019738	GCTT	2	8	219889	219896	0 %	50 %	25 %	25 %	428308558
3029	NC_019738	TGG	2	6	219900	219905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308558
3030	NC_019738	T	7	7	220481	220487	0 %	100 %	0 %	0 %	428308559
3031	NC_019738	TGC	2	6	220515	220520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308559
3032	NC_019738	CAC	2	6	220722	220727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308559
3033	NC_019738	CAA	2	6	220740	220745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308559
3034	NC_019738	AAT	2	6	220753	220758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308559
3035	NC_019738	CAA	2	6	220887	220892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308559
3036	NC_019738	ATC	2	6	220963	220968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308559
3037	NC_019738	A	6	6	220979	220984	100 %	0 %	0 %	0 %	428308559
3038	NC_019738	CGATT	2	10	220997	221006	20 %	40 %	20 %	20 %	428308559
3039	NC_019738	T	6	6	221005	221010	0 %	100 %	0 %	0 %	428308559
3040	NC_019738	G	6	6	221073	221078	0 %	0 %	100 %	0 %	428308559
3041	NC_019738	AAG	2	6	221258	221263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308559
3042	NC_019738	CAG	2	6	221311	221316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308559
3043	NC_019738	AAG	2	6	221333	221338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308559
3044	NC_019738	CCCG	2	8	221373	221380	0 %	0 %	25 %	75 %	428308559
3045	NC_019738	TCT	2	6	221412	221417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308559
3046	NC_019738	TGC	2	6	221426	221431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308559
3047	NC_019738	TGA	2	6	221460	221465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308559
3048	NC_019738	TGG	2	6	221469	221474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308559
3049	NC_019738	AGA	2	6	221508	221513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308559
3050	NC_019738	ATG	2	6	221531	221536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308559
3051	NC_019738	GCA	2	6	221557	221562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308559
3052	NC_019738	TAG	2	6	221574	221579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308559
3053	NC_019738	TAA	2	6	221586	221591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308559
3054	NC_019738	TCCT	2	8	221978	221985	0 %	50 %	0 %	50 %	428308560
3055	NC_019738	CAG	2	6	222013	222018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308560
3056	NC_019738	GCT	2	6	222026	222031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308560
3057	NC_019738	CTC	2	6	222156	222161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308560
3058	NC_019738	GTGA	2	8	222410	222417	25 %	25 %	50 %	0 %	428308560
3059	NC_019738	AGC	2	6	222419	222424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308560
3060	NC_019738	GCAG	2	8	222508	222515	25 %	0 %	50 %	25 %	428308560
3061	NC_019738	TGG	2	6	222592	222597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308560
3062	NC_019738	GTG	2	6	222612	222617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308560
3063	NC_019738	TTAA	2	8	222644	222651	50 %	50 %	0 %	0 %	428308560
3064	NC_019738	TCA	2	6	222696	222701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308560
3065	NC_019738	GA	3	6	222705	222710	50 %	0 %	50 %	0 %	428308560
3066	NC_019738	CTTA	2	8	222731	222738	25 %	50 %	0 %	25 %	428308560
3067	NC_019738	TTTC	2	8	222742	222749	0 %	75 %	0 %	25 %	428308560
3068	NC_019738	CCG	2	6	222756	222761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308560
3069	NC_019738	TGGG	2	8	222795	222802	0 %	25 %	75 %	0 %	428308560
3070	NC_019738	GAT	2	6	222824	222829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308560
3071	NC_019738	TTG	2	6	222885	222890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308560
3072	NC_019738	CTAAT	2	10	223532	223541	40 %	40 %	0 %	20 %	428308561
3073	NC_019738	CAA	2	6	223621	223626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308561
3074	NC_019738	ATT	2	6	223675	223680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308561
3075	NC_019738	TAC	2	6	223700	223705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308561
3076	NC_019738	GA	3	6	223793	223798	50 %	0 %	50 %	0 %	428308561
3077	NC_019738	TAA	2	6	224004	224009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308562
3078	NC_019738	AAT	2	6	224040	224045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308562
3079	NC_019738	A	6	6	224048	224053	100 %	0 %	0 %	0 %	428308562
3080	NC_019738	AAT	2	6	224101	224106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308562
3081	NC_019738	CAT	2	6	224121	224126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308562
3082	NC_019738	TGT	2	6	224149	224154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308562
3083	NC_019738	CCA	2	6	224158	224163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308562
3084	NC_019738	CT	3	6	224193	224198	0 %	50 %	0 %	50 %	428308562
3085	NC_019738	GAC	2	6	224315	224320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308562
3086	NC_019738	TAA	2	6	224418	224423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308562
3087	NC_019738	GTG	2	6	224443	224448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308562
3088	NC_019738	AAC	2	6	224481	224486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308562
3089	NC_019738	ATA	2	6	224538	224543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308562
3090	NC_019738	TCT	4	12	224657	224668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308563
3091	NC_019738	CAC	2	6	224779	224784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308563
3092	NC_019738	CTC	2	6	225052	225057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308563
3093	NC_019738	G	6	6	225070	225075	0 %	0 %	100 %	0 %	428308563
3094	NC_019738	TTA	2	6	225152	225157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308563
3095	NC_019738	A	6	6	225289	225294	100 %	0 %	0 %	0 %	428308563
3096	NC_019738	AAT	2	6	225334	225339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308563
3097	NC_019738	CGG	2	6	225372	225377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308563
3098	NC_019738	AGT	2	6	225416	225421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308563
3099	NC_019738	ATT	2	6	225425	225430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308563
3100	NC_019738	CAT	2	6	225464	225469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308564
3101	NC_019738	GGAC	2	8	225520	225527	25 %	0 %	50 %	25 %	428308564
3102	NC_019738	ATC	2	6	225529	225534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308564
3103	NC_019738	AAACAG	2	12	225555	225566	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428308564
3104	NC_019738	TGG	2	6	225590	225595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308564
3105	NC_019738	TC	3	6	225604	225609	0 %	50 %	0 %	50 %	428308564
3106	NC_019738	TGG	2	6	225612	225617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308564
3107	NC_019738	CCG	2	6	225695	225700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308564
3108	NC_019738	ATA	2	6	225706	225711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308564
3109	NC_019738	C	6	6	225715	225720	0 %	0 %	0 %	100 %	428308564
3110	NC_019738	CATA	2	8	225762	225769	50 %	25 %	0 %	25 %	428308564
3111	NC_019738	GAT	2	6	225771	225776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308564
3112	NC_019738	ACGGAA	2	12	225778	225789	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428308564
3113	NC_019738	AATT	2	8	225899	225906	50 %	50 %	0 %	0 %	428308564
3114	NC_019738	GAC	2	6	225977	225982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308564
3115	NC_019738	AGT	2	6	226022	226027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308564
3116	NC_019738	CCT	2	6	226108	226113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308564
3117	NC_019738	GAC	2	6	226163	226168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308564
3118	NC_019738	C	6	6	226283	226288	0 %	0 %	0 %	100 %	428308564
3119	NC_019738	GCG	2	6	226330	226335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308564
3120	NC_019738	GCA	2	6	226342	226347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308564
3121	NC_019738	ATA	2	6	226397	226402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308564
3122	NC_019738	AAG	2	6	226429	226434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308564
3123	NC_019738	GATTTG	2	12	226506	226517	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428308564
3124	NC_019738	GAT	3	9	226518	226526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308564
3125	NC_019738	CAA	2	6	226556	226561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308564
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3231	NC_019738	CAG	2	6	233551	233556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308571
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3235	NC_019738	GTT	2	6	233759	233764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308571
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3237	NC_019738	TGT	2	6	234135	234140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308572
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3239	NC_019738	CAA	2	6	234167	234172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308572
3240	NC_019738	TCAT	2	8	234196	234203	25 %	50 %	0 %	25 %	428308572
3241	NC_019738	AGGA	2	8	234359	234366	50 %	0 %	50 %	0 %	428308572
3242	NC_019738	ACGACA	2	12	234460	234471	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428308572
3243	NC_019738	CAT	2	6	234725	234730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308573
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3245	NC_019738	CCA	2	6	234837	234842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308573
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3489	NC_019738	ATA	2	6	252120	252125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308590
3490	NC_019738	CCAT	2	8	252181	252188	25 %	25 %	0 %	50 %	428308590
3491	NC_019738	GCA	2	6	252305	252310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308590
3492	NC_019738	CAT	2	6	252332	252337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308590
3493	NC_019738	GATA	2	8	252427	252434	50 %	25 %	25 %	0 %	428308590
3494	NC_019738	TAA	2	6	252440	252445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308590
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3496	NC_019738	GA	3	6	252478	252483	50 %	0 %	50 %	0 %	428308590
3497	NC_019738	TCT	2	6	252524	252529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308590
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